1、分子是由原子组合而成的，原子和分子比较并无实际意义。原子按照一定的顺序和空间排列组合而成分子，原子是保持物质化学属性的最小粒子，分子是物质中能够独立存在的相对稳定并保持该物质物理化学特性的最小单元。原子核分子比较大小并无实际意义，对于同一种物质中的分子来讲，其内部的原子一定小于分子。
2、不一定。只有同种元素的分子和原子才能比较大小。对于多数原子分子来说，分子比原子大，如氧气分子大于氧原子。不同种元素的分子和原子不能比较大小。分子和原子不能比较大小；分子是由原子构成的；故对于同种元素组成的物质来说，分子比原子大。
3、你的分析也是有道理的，“不同种类的分子与原子不能比较大小”，这种说法的本意是说，比如氢分子可以与氢原子比较大小，因为1个氢分子由两个氢原子构成，所以1个氢分子比1个氢原子大；而对于氧原子与氢分子则不能说氢分子比氧原子大。可以类推比较其他粒子的大小，这些到高中必修二会学。
4、同一种物质如果能用分子式表示的话，可以比较。比如一个氧气分子要比一个一个氧原子大；一个氩气分子和一个氩原子一样大。离子化合物氯化钠是由离子构成的，没有分子式，只有化学式，不能比较大小。不同物质要比较大小，首先也要求能用分子式表示，大小根据元素周期律比较。
